[发明专利]一种肝癌关键蛋白与临床关系分析方法

摘要

本发明公开了一种肝癌关键蛋白与临床关系分析方法，通过生物信息学分析，解析最终所筛选出的肝癌关键蛋白多肽的功能；通过大样本MRM绝对定量验证，计算肝癌关键蛋白多肽诊断肝癌的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值，以及与肝癌临床不同病理类型、不同病程、原发与转移、疗效等相关分析，提出它们在肝癌的预防、早期诊断、病程预测和预后判断等临床应用方面的可行性；肝癌是广西第一位癌症杀手。寻找有效的肿瘤标志物用于癌变机理研究、疾病的早期诊断及预后判断具有重要意义。

主权项

一种肝癌关键蛋白与临床关系分析方法，其特征在于：由以下步骤组成：通过生物信息学分析，解析最终所筛选出的肝癌关键蛋白多肽的功能；通过大样本MRM绝对定量验证，计算肝癌关键蛋白多肽诊断肝癌的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值，以及与肝癌临床不同病理类型、不同病程、原发与转移、疗效等相关分析，提出它们在肝癌的预防、早期诊断、病程预测和预后判断等临床应用方面的可行性；①通过IntACT、Reactome、 ConsensusPathDB、LOMA、The Human Protein Reference Database、human protein‑protein interaction prediction database等数据库对关键蛋白相互作用进行检索，利用Pajek、cytoscape等软件构建肝癌血清关键蛋白多肽调控网络，解析最终所筛选出的肝癌关键蛋白多肽的功能；②将原发性肝癌和对照样本例数扩大到1000例，以第一部分相对定量结果作为参考，确定最终所筛选出的肝癌关键蛋白多肽的检测范围；体外合成最终所筛选出的肝癌关键蛋白多肽作为标准品，梯度稀释加入血清做标准曲线；MIDAS实验定量分析1000例原发性肝癌和对照样本中肝癌关键蛋白多肽含量；③计算肝癌关键蛋白多肽诊断肝癌的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值，评价其作为诊断指标的价值；④分析1000例原发性肝癌样本中肝癌关键蛋白多肽含量与肝癌临床不同病理类型、不同病程、原发与转移、疗效等相关关系，提出它们在肝癌的预防、早期诊断和预后判断等临床应用方面的可行性。