[发明专利]一种预测微生物和疾病关系的方法有效

专利信息
申请号: 201710832012.4 申请日: 2017-09-15
公开(公告)号: CN107610784B 公开(公告)日: 2020-10-23
发明(设计)人: 张祖平;邹帅;张敬普 申请(专利权)人: 中南大学
主分类号: G16H50/70 分类号: G16H50/70;G06K9/62
代理公司: 长沙七源专利代理事务所(普通合伙) 43214 代理人: 郑隽;周晓艳
地址: 410083 湖南*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开了一种预测微生物和疾病关系的方法,根据已知的微生物‑疾病关系数据和基于症状的疾病相似性数据构建微生物相似性网络和疾病相似性网络,然后通过网络一致性投影来预测潜在的微生物和疾病之间的关系。本发明与以前的技术相比,集成了基于症状的疾病相似性数据,且整个计算过程无需任何参数,适用于已知微生物‑疾病关系数据很少的情况,能够更加准确地预测出微生物和疾病的关系。本发明是一种基于全局的计算方法,因此可以大规模地预测出多对微生物‑疾病之间的关系,并且能够有效地解决生物实验方法的盲目性、成本高的问题。
搜索关键词: 一种 预测 微生物 疾病 关系 方法
【主权项】:
一种预测微生物和疾病关系的方法,所述方法包括如下步骤:获取微生物空间投影,具体是:根据已知的微生物‑疾病关系数据计算微生物之间的相似性分数,构建微生物相似性网络;将微生物相似性网络投影到已知的微生物‑疾病关系网络上,计算出微生物空间投影所得到微生物和疾病的关联分数;获取疾病空间投影,具体是:根据已知的微生物‑疾病关系数据计算疾病之间的相似性分数;集成基于症状的疾病相似性构建疾病相似性网络;将疾病相似性网络投影到已知的微生物‑疾病关系网络上,计算出疾病空间投影所得到的微生物和疾病的关联分数;获取微生物与疾病的关联性关系,具体是:将微生物空间投影所得到微生物和疾病的关联分数与疾病空间投影所得到的微生物和疾病的关联分数结合起来,得到微生物‑疾病关联分数;根据微生物‑疾病关联分数的排序判定微生物和疾病的关联性。
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