[发明专利]一种基于高通量测序的数据分析方法有效
申请号: | 201710656413.9 | 申请日: | 2017-08-03 |
公开(公告)号: | CN107516021B | 公开(公告)日: | 2019-11-19 |
发明(设计)人: | 温颜华 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10 |
代理公司: | 11002 北京路浩知识产权代理有限公司 | 代理人: | 王莹;李官<国际申请>=<国际公布>=< |
地址: | 101300 北京市顺义区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开一种基于高通量测序的数据分析方法。其中,所述方法包括:获取参考测序样品和对照测序样品,获得三种的RNA的差异DNA甲基化区域相关的表达水平出现差异的RNA,获得甲基化水平和表达水平高度相关的RNA,构成候选竞争性内源RNA调控关系对,生成候选竞争性内源RNA网络,筛选出hub节点,并将所述hub节点进行癌症的体细胞突变收录数据库注释。本发明提供的基于高通量测序的数据分析方法,将hub节点在癌症的体细胞突变收录数据库进行注释,发现癌症相关的竞争性内源RNA调控关系,预测癌症发生发展过程总的调控机制,提高了对癌症致病机理预测的准确性。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 通量 数据 分析 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于高通量测序的数据分析方法,其特征在于,包括:/n获取参考测序样品和对照测序样品,其中,所述参考测序样品来源于正常样本,所述对照测序样品来源于异常样本;/n根据对所述参考测序样品进行高通量测序获取的三种RNA中每个RNA的第一表达水平和每个胞嘧啶C位点的第一DNA甲基化水平、对所述对照测序样品获得的所述每个RNA的第二表达水平和所述每个胞嘧啶C位点的第二DNA甲基化水平,以及第一预设规则获得所述三种RNA中与差异DNA甲基化区域相关的所述表达水平出现差异的RNA;/n根据对所述参考测序样品和所述对照测序样品进行高通量测序获得所述三种RNA中每个RNA的甲基化水平、所述第一表达水平和所述第二表达水平,以及第二预设规则获得甲基化水平与表达水平高度相关的RNA;/n根据对所述参考测序样品和所述对照测序样品进行高通量测序获取到的每个miRNA的序列信息和所述三种RNA中每个RNA的序列信息,以及第三预设规则获得构成候选竞争性内源RNA调控关系对;/n根据所述与差异DNA甲基化区域相关的所述表达水平出现差异的RNA、所述甲基化水平与表达水平高度相关的RNA、所述构成候选竞争性内源RNA调控关系对,以及第四预设规则生成候选竞争性内源RNA网络;/n根据所述候选竞争性内源RNA网络,以及第五预设规则获得hub节点,并将所述hub节点进行癌症的体细胞突变收录数据库注释。/n
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