[发明专利]基于云平台的生物信息分析系统在审
| 申请号: | 201710598332.8 | 申请日: | 2017-07-21 |
| 公开(公告)号: | CN107239675A | 公开(公告)日: | 2017-10-10 |
| 发明(设计)人: | 郭权;余果;任一;张磊;周勇;张祥林;黄华生 | 申请(专利权)人: | 上海桑格信息技术有限公司 |
| 主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10;H04L29/08 |
| 代理公司: | 上海恒锐佳知识产权代理事务所(普通合伙)31286 | 代理人: | 黄海霞 |
| 地址: | 201321 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种基于云平台的生物信息分析系统,包括云平台客户端、云平台web服务器和云平台计算系统,云平台客户端和云平台web服务器之间通过网络收发信息,云平台web服务器和云平台计算系统通过Nginx网页服务器交换数据;云平台web服务器包括生物信息分析请求接口,云平台计算系统包括生物信息分析应用接口、生物信息分析组件、存储服务器、Mysql数据库和Mongo数据库;生物信息分析请求接口通过Nginx网页服务器连接至生物信息分析应用接口,生物信息分析应用接口的输出端通过工作流进程管理单元连接至生物信息分析组件。本发明的分析程序模块化,可组合复用,分析效率大为提高,部署方便。 | ||
| 搜索关键词: | 基于 平台 生物 信息 分析 系统 | ||
【主权项】:
基于云平台的生物信息分析系统,其特征在于,包括云平台客户端、云平台web服务器和云平台计算系统;所述云平台客户端和所述云平台web服务器之间通过网络收发信息,所述云平台web服务器和所述云平台计算系统之间通过Nginx网页服务器交换数据;所述云平台web服务器包括生物信息分析请求接口;所述云平台计算系统包括生物信息分析应用接口、生物信息分析组件、存储服务器、Mysql数据库和Mongo数据库;所述云平台计算系统还包括若干计算节点,用于对生物信息进行分析计算;所述生物信息分析请求接口通过所述Nginx网页服务器连接至所述生物信息分析应用接口,所述生物信息分析应用接口的输出端通过工作流进程管理单元连接至所述生物信息分析组件的输入端,所述生物信息分析组件的输出端分别连接至所述存储服务器、Mysql数据库和Mongo数据库;所述生物信息分析请求接口向所述生物信息分析应用接口发出生物信息分析请求并发送参数;所述存储服务器用于存储分析结果数据,所述Mysql数据库用于存储分析记录、状态和日志信息,所述Mongo数据库用于存储供所述云平台客户端展示的图表数据。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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