[发明专利]α1

摘要

本发明涉及一种α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型及其建立方法，建立方法包括步骤：以α1‑AR亚型蛋白的氨基酸序列为探针，搜索蛋白晶体数据库，通过氨基酸序列比对得到相似度最高的同源模板β2‑AR；使用的Prime模块对α1‑AR亚型蛋白同源模建；采用Macromodel模块对同源模建得到的蛋白优化，通过模型评价得到α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型。本发明提供了α1‑AR三个亚型蛋白α1A‑AR、α1B‑AR和α1D‑AR的模型构象，为准确研究靶点和拮抗剂的构效关系提供了基础；并模建了可能的结合口袋，找到关键残基，为解释α1‑AR亚型选择性拮抗剂的选择度提供理论依据。

主权项

一种α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型的建立方法，其特征在于，包括如下步骤：以α1‑AR亚型蛋白的氨基酸序列为探针，搜索蛋白晶体数据库，得到同源模板；通过氨基酸序列比对，使用的Prime模块对α1‑AR亚型蛋白进行同源模建；采用的Macromodel模块对所述同源模建得到的蛋白进行优化，得到α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型。