[发明专利]一种基于功能模块的疾病关联因子识别方法及系统

摘要

本发明提供了一种基于功能模块的疾病关联因子识别方法及系统，该方法包括1)在人类共调控网络上识别包括转录因子、miRNA和目标基因的功能模块；2)获得差异表达基因的p‑value值，根据模块内差异表达基因的组合确定疾病关联功能模块；3)将疾病关联功能模块中的非差异表达转录因子、miRNA和目标基因作为候选疾病关联因子；4)计算候选疾病关联因子与疾病的关联值，并根据关联值为候选疾病关联因子排序。该方法识别疾病关联因子时结合了多种相互作用关系，即使在不知道转录因子、miRNA和基因功能的情况下，应用本发明所述方法能够进行预测识别疾病关联因子，且本发明预测疾病关联因子的准确率非常高。

主权项

一种基于功能模块的疾病关联因子识别方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一：构建人类共调控网络，利用功能模块识别方法从人类共调控网络中识别miRNA、转录因子和基因的功能模块，并计算每个功能模块的疾病关联值；步骤二：依据每个功能模块的疾病关联值，筛选出疾病关联模块；步骤三：将每个疾病关联模块中的非差异表达的miRNA、转录因子和基因作为候选疾病关联因子；步骤四：根据候选疾病关联因子在各个功能模块内与差异表达基因的距离分布，计算候选疾病关联因子与疾病的关联值，并根据候选疾病关联因子与疾病的关联值大小对候选疾病关联因子从大到小排序，识别出疾病关键因子。