[发明专利]用于预测转基因沉默风险的方法和系统有效
| 申请号： | 201680058734.2 | 申请日： | 2016-10-25 |
| 公开（公告）号： | CN108292328B | 公开（公告）日： | 2022-04-19 |
| 发明（设计）人： | 王伯豪;S·史利南;L·塞斯崔-登特 | 申请（专利权）人： | 美国陶氏益农公司 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B25/10;G16B30/10;C12N15/82;C12N5/14 |
| 代理公司： | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人： | 罗天乐 |
| 地址： | 美国印*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明基于使用植物基因组中的H3K9me2甲基化水平来预测转基因沉默、转基因稳定性和/或转基因表达水平。提供了用于生成全基因组H3K9me2图谱的方法和/或系统及其与指定阈值一起用于预测基因沉默的用途。本文提供的所述方法和/或系统可用于高通量设置中，用以在与现有技术相比相对短的时间段内筛选大量转化事件。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 预测 转基因 沉默 风险 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种用于预测转基因沉默风险的方法，其包括：(a)生成植物基因组中的组蛋白甲基化/乙酰化曲线数据；(b)汇集步骤(a)的所述组蛋白甲基化/乙酰化曲线数据至组蛋白甲基化/乙酰化数据库，所述数据库显示所述组蛋白甲基化/乙酰化曲线的峰数；(c)分析至少一个转基因插入位点的序列；并且(d)将步骤(c)的所述转基因插入位点的序列与步骤(b)的所述组蛋白甲基化/乙酰化数据库进行比较；其中(i)如果所述转基因插入位点落入所述组蛋白甲基化/乙酰化曲线的峰零或峰一处，则不存在转基因沉默的风险，或(ii)如果所述转基因插入位点落入所述组蛋白甲基化/乙酰化曲线的峰二或以上，则存在显著的转基因沉默风险。
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