[发明专利]一种流式细胞数据快速自动分群及圈门方法

摘要

本发明提供了一种流式细胞数据快速自动分群及圈门方法，所述方法包括以下步骤步骤一，用核主成分分析处理流式细胞数据；步骤二，通过余弦相似度的K‑means聚类方法实现细胞圈门；步骤三，绘制二维或三维散点图，将处理后得到的核主成分设置为坐标轴；步骤四，不同亚群细胞之间根据细胞分类标签进行圈门，完成细胞自动分群。

主权项

一种流式细胞数据快速自动分群及圈门方法，所述方法包括以下步骤：步骤一，用核主成分分析处理流式细胞数据，包括以下子步骤：1)输入待分析流式细胞数据；2)数据标准化；3)确定核函数及核参数，计算核矩阵；4)获得核矩阵的特征值和特征向量；5)根据累计贡献率的大小，选取最大的几个特征值所对应的特征向量作为投影方向；6)进行核主成分分析映射，获得降维后的数据；步骤二，通过余弦相似度的K‑means聚类方法实现细胞圈门，包括以下子步骤：7)根据数据相关信息，确定聚类个数C；8)计算数据向量之间的夹角余弦值，找到余弦相似度最小的两个数据点作为初始质心，然后找寻与前两个初始质心所在向量间夹角最大的数据向量作为第三个初始质心，依次确定C个初始质心；9)计算其余的数据点与初始质心的夹角余弦值，根据余弦相似度，将数据点归类到最近的类群中；10)更新每个类群的质心；11)若各质心之间的余弦相似度大于给定误差阈值，循环执行9)、10)步；若达到迭代次数或类群质心不发生改变，结束聚类；步骤三，绘制二维或三维散点图，将处理后得到的核主成分设置为坐标轴；步骤四，不同亚群细胞之间根据细胞分类标签进行圈门，完成细胞自动分群。