[发明专利]一种根据相似度预先分组的DNA测序图像处理系统有效
申请号: | 201610710399.1 | 申请日: | 2016-08-23 |
公开(公告)号: | CN106250720B | 公开(公告)日: | 2019-08-09 |
发明(设计)人: | 盖彦龙 | 申请(专利权)人: | 山东卫康医学检验有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G06K9/62;G06T7/00 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 陈娟 |
地址: | 255000 山东省淄博市高新区*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明涉及一种根据相似度预先分组的DNA测序图像处理系统,包括:反应芯片,其上通过待测序的液体,并与反应芯片内的反应液进行反应;CCD相机,其设置在DNA测序仪一侧用来获取测序芯片上的反应信息的图像;还包括与CCD相机连接并获取拍摄的图片信息的CCD相机获取模块;所述的CCD相机获取模块按照预设的程序获取存储在CCD相机内的图像信息。本发明在对各个图像信息进行处理时,并不是按照图像获取的先后顺序与标准碱基图像进行比对,而是预先将相似信息的图像进行分组集中进行比对,最后通过时序的先后顺序碱基重新进行排序,最终输出碱基信息。 | ||
搜索关键词: | 一种 根据 相似 预先 分组 dna 图像 处理 系统 | ||
【主权项】:
1.一种根据相似度预先分组的DNA测序图像处理系统,其特征在于,包括:反应芯片,其上通过待测序的液体,并与反应芯片内的反应液进行反应;CCD相机,其设置在DNA测序仪一侧用来获取测序芯片上的反应信息的图像;还包括与CCD相机连接并获取拍摄的图片信息的CCD相机获取模块;所述的CCD相机获取模块按照预设的程序获取存储在CCD相机内的图像信息;信号分组模块,其将CCD相机获取模块的信息按照相似度将各个碱基的图像信息分别分组获取并存储,在进行分组时,所述的信号分组模块将各个碱基的时序进行记载,数据格式按照获取矩阵(p,q,f),其中,p表示各个碱基图像的时间序列,q表示碱基的图像拍摄信息,f表示某一碱基类型;碱基识别模块,其将信号分组模块获取的各碱基信息与标准的碱基图像信息进行比对,并且,将不符合的碱基图像信息,分别传输至信号分组模块中,由信号分组模块重新进行分组,重新进行识别比对;碱基排序模块,在碱基识别完全后,所有数据传输至碱基排序模块中,并按照获取矩阵(p,q,f)中的时间序列重新排列各个碱基信息;还包括序列生成模块,所述的序列生成模块,将碱基排序模块排序的各个碱基信息与CCD相机获取图像的顺序一一比对,完全一致时,输出碱基序列;在不一致时,所述的碱基排序模块重新进行排序,然后输出。
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