[发明专利]生物基因多位点性状的遗传解释完整度检测方法及系统有效
申请号: | 201610623216.2 | 申请日: | 2016-08-01 |
公开(公告)号: | CN106250719B | 公开(公告)日: | 2017-12-26 |
发明(设计)人: | 魏文娟;周庆华;宋卓;陈香 | 申请(专利权)人: | 人和未来生物科技(长沙)有限公司 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 湖南兆弘专利事务所(普通合伙)43008 | 代理人: | 谭武艺 |
地址: | 410152 湖南省长沙*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明公开了一种生物基因多位点性状的遗传解释完整度检测方法及系统,检测方法步骤包括确定目标性状的各个相关位点及其基因型,计算每一个相关位点下各个基因型的比值比OR;将每一个相关位点下各个基因型的比值比OR以自然对数e为底求对数得到对数b;将得到的对数b分别按照绝对值排序并取最大值,得到每一个相关位点的基因比值比最大值|b|max;将所有相关位点的基因比值比最大值|b|max求和得到基因比值比最大值总和|b|sum;将基因比值比最大值|b|max除以基因比值比最大值总和|b|sum,得到遗传解释完整度比值GIIR;系统包括比值比计算单元、对数单元、最大值求取单元、求和单元和遗传解释完整度计算单元。本发明具有能够准确有效检测生物性状的解读完整性、适应性好的优点。 | ||
搜索关键词: | 生物 基因 多位点 性状 遗传 解释 完整 检测 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种生物基因多位点性状的遗传解释完整度检测方法,其特征在于步骤包括:1)确定目标性状的各个相关位点及其基因型,计算每一个相关位点下各个基因型的比值比OR;2)将每一个相关位点下各个基因型的比值比OR以自然对数e为底求对数得到对数b;3)将得到的对数b分别按照绝对值排序并取最大值,得到每一个相关位点的基因比值比最大值|b|max;4)将所有相关位点的基因比值比最大值|b|max求和得到基因比值比最大值总和|b|sum;5)按照基因比值比最大值|b|max的值对所有相关位点进行降序排序;依次从排序得到的顺序表中取出第一个相关位点作为当前位点,将当前位点的基因比值比最大值|b|max、所有序号比当前位点小的位点的基因比值比最大值|b|max求和得到基因比值比最大值局部总和|b|sum1,将基因比值比最大值局部总和|b|sum1除以基因比值比最大值总和|b|sum,得到当前位点对应的遗传解释完整度比值GIIR。
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