[发明专利]一种用于细胞的识别计数方法

摘要

本发明公开了一种用于细胞的识别计数方法，包括9个步骤：对微米级显微采集环境下的图像进行预处理；对预处理后获得的图像进行细胞孔洞提取；利用连通域的知识进行细胞的封闭孔洞填充；在步骤3中填充后的图像中提取细胞的轮廓线点序列；采用基于圆形度判定的不封闭孔洞填充方法对细胞的不封闭孔洞进行填充；将填充后的图像进行倒角变换；利用中的细胞孔洞位置进行极值唯一化标记；使用基于标记的分水岭方法对极值唯一化后的图像进行分割；将分割得到的结果进行量化、标记。有益的技术效果：本发明能够大大减少图像噪声的影响，改善过分割、分割线不连续现象，提高分割效果，增加细胞识别率。

主权项

1.一种用于细胞的识别计数方法，其特征在于：通过电脑按如下步骤进行：步骤1，通过微米级显微设备获取细胞原始图像A；所述的细胞原始图像A由含有孔洞的细胞图像和背景图像2部分构成；其中，含有孔洞细胞图像进一步分为2种：封闭孔洞的细胞图像、不封闭孔洞的细胞图像；对微米级显微镜采集环境下获得的原始图像A进行图像二值化预处理，获得经过二值化处理的图像B；经过二值化处理的图像B内的像素点的灰度值只有2种，将这两种灰度值分别记为高值灰度和低值灰度；其中，经过预处理的图像B中的细胞边缘上的像素点为低值灰度，经过预处理的图像B中的背景和细胞孔洞的像素点的灰度值为高值灰度；经过二值化处理的图像B，由封闭孔洞的二值化图像区域、不封闭孔洞的二值化图像区域、二值化背景图像区域3部分构成；其中，封闭孔洞的二值化图像区域、不封闭孔洞的二值化图像区域、二值化背景图像分别与原始图像A中的封闭孔洞的图像区域、不封闭孔洞的图像区域、背景图像区域相对应；步骤2，采用基于连通域的孔洞分割方法对经过二值化处理的图像B进行细胞孔洞提取，即将封闭孔洞的二值化细胞图像全部标记出来，将封闭孔洞的二值化图像所覆盖的区域简称为封闭孔洞区域，封闭孔洞区域内的像素点的所有位置坐标(i，j)组成封闭孔洞区域内像素点的位置集合Ω；步骤3，将封闭孔洞区域内像素点的位置集合Ω中的所有像素点的位置坐标(i，j)所对应的灰度值记为f(i，j)，将该灰度值f(i，j)设为0，即对经过二值化处理的图像B中封闭孔洞的二值化图像区域进行填充，得到一次填充后的图像C；步骤4，对一次填充后的图像C提取细胞的轮廓，获得细胞轮廓的线点序列集合contours；步骤5，采用基于圆形度判定法，对由步骤4获得的线点序列集合contours进行填充，即对不封闭孔洞的二值化图像区域进行填充，得到二次填充后的图像D；步骤6，对二次填充的图像D进行取反操作，获得经过取反处理的图像E；对经过取反操作处理的图像E进行倒角距离变换，获得经过倒角变换的图像T；对经过倒角变换的图像T进行消除极小值、非线性变换、和取反操作处理，获得再次取反后的图像I；步骤7，根据封闭孔洞区域内像素点的位置集合Ω，在再次取反后的图像I中进行细胞孔洞极值唯一化标记，将与封闭孔洞区域内像素点的位置集合Ω中位置相对应的像素点的值f(i，j)标记为MINIMUM，得到经过唯一化标记极值的图像J；步骤8，使用分水岭方法对经过唯一化标记极值的图像J上进行图像分割，得到分割后的细胞图像R；步骤9，对分割后的图像R进行细胞标记和量化，得到细胞的数量和每个细胞的位置坐标，即得到结果。