[发明专利]用于计算经校正扩增子覆盖度的方法、系统及计算机可读媒体有效
申请号: | 201580054718.1 | 申请日: | 2015-10-09 |
公开(公告)号: | CN107111692B | 公开(公告)日: | 2021-10-29 |
发明(设计)人: | J·维奇;展逸屏 | 申请(专利权)人: | 生命科技股份有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B25/00;G16B30/10 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 张欣 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 本发明公开用于计算经校正扩增子覆盖度的方法、系统及计算机可读媒体。一种方法包含:将基于疑具有一或多个遗传畸变的样品的经扩增靶区域的多个扩增子的多个读段映射到包含对应于所述经扩增靶区域的一或多个核酸序列的参考序列;计算扩增子覆盖度及总读段,其中扩增子覆盖度为映射到扩增子的多个读段,且总读段为多个经映射读段;及经由应用分批效果校正基于所述计算出的扩增子覆盖度及所计算出的总读段计算经校正扩增子覆盖度。 | ||
搜索关键词: | 用于 计算 校正 扩增 覆盖 方法 系统 计算机 可读 媒体 | ||
【主权项】:
一种用于计算经校正扩增子覆盖度的计算机实施的方法,所述方法包括:将基于疑具有一或多个遗传畸变的样品的经扩增靶区域的多个扩增子的多个读段映射到参考序列,所述参考序列包含对应于所述经扩增靶区域的一或多个核酸序列;计算扩增子覆盖度及总读段,其中扩增子覆盖度为经映射到扩增子的多个读段,且总读段为多个经映射读段;及经由应用分批效果校正基于所述计算出的扩增子覆盖度及所计算出的总读段计算经校正扩增子覆盖度。
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