[发明专利]一种针对高通量基因测序图像的去噪方法有效

专利信息
申请号: 201510433962.0 申请日: 2015-07-22
公开(公告)号: CN105205788B 公开(公告)日: 2018-06-01
发明(设计)人: 颜珂;徐勇 申请(专利权)人: 哈尔滨工业大学深圳研究生院
主分类号: G06T5/00 分类号: G06T5/00
代理公司: 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) 44248 代理人: 张英;韩云涵
地址: 518000 广东省深*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提出了一种基于à trous小波阈值去噪方法,应用于高通量基因测序图像去噪。本发明主要是对基于硬阈值的各向同性非抽取离散小波算法的改进,具体操作是使用特定的小波对高通量基因测序的图像进行小波分解,针对每一层小波系数,提出使用l1范数计算全局阈值。通过全局阈值和每一层小波系数构建估计小波系数表达式,最后使用小波重构算法得到去噪后的图像。本发明的方法相对于现有技术中具有去噪性能更好的优点,并且通过几组实验数据对比,证明本发明的合理性和鲁棒性。
搜索关键词: 基因测序 小波系数 高通量 去噪 图像 小波重构算法 小波阈值去噪 实验数据 图像去噪 小波分解 小波算法 鲁棒性 范数 构建 小波 合理性 全局 抽取 应用 改进
【主权项】:
1.一种针对高通量基因测序图像的去噪方法,其包括以下步骤:(1)对测序图像使用小波函数进行小波分解,得到每一层小波系数ωi,具体为采用àtrous小波和它的β-3spline version对图像进行小波分解,包括如下步骤:a.初始化i=0,则第0层的图像为原图M0;b.变量i自加,图像Mi-1每行每列都与一个一维的核h进行卷积,卷积后图像表示为Mi,核h表示为矩阵并且在矩阵的元素之间插入(2i-1-1)个零;c.计算每一层小波系数:ωi(k)=Mi-1(k)-Mi(k);(2)针对每一层小波系数,计算出当前小波系数对应的全局阈值λi λ i = k m 1 * m 2 | | ω i - m e d i a n ( ω i ) | | 1 , ]]>其中median(ωi)代表小波系数ωi对应的中值,m1,m2代表图像的行和列,k代表系数;(3)通过每一层小波系数ωi和对应的全局阈值λi,求出每一层小波系数对应的估计小波系数; ω ~ i = 0 , | ω i | ≤ λ i sgn ( ω i ) ( | ω i | - r * λ i * α 1 | | ω i - λ i | | 2 ) , | ω i |
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