[发明专利]一种串联质谱谱图鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201410382707.3 申请日: 2014-08-06
公开(公告)号: CN104182658B 公开(公告)日: 2017-05-03
发明(设计)人: 何昆;曾文锋;付岩;迟浩;贺思敏 申请(专利权)人: 中国科学院计算技术研究所
主分类号: G06F19/24 分类号: G06F19/24;G01N27/62
代理公司: 北京泛华伟业知识产权代理有限公司11280 代理人: 王勇
地址: 100190 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供一种串联质谱谱图鉴定方法,其特征在于,包括下列步骤1)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图,分别在全局序列库中进行限制性搜索,获得各谱图的匹配肽段;2)根据步骤1)所得各谱图的匹配肽段,构建局部序列库,对于待鉴定谱图数据集的每张谱图,分别在所述局部序列库中进行开放式搜索,获得与一部分谱图相匹配的带修饰的肽段,并获得所带修饰的质量和误差区间;3)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图,根据步骤2)所匹配的修饰的质量和误差区间以及当前待鉴定谱图的质量,设定限制性搜索区间,并在全局序列库中进行搜索,获得最终的匹配结果。本发明能够提高串联质谱谱图鉴定的鉴定率和准确度,并且具有较高的搜索速度。
搜索关键词: 一种 串联 质谱谱 图鉴 方法
【主权项】:
一种串联质谱谱图鉴定方法,其特征在于,包括下列步骤:1)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图,分别在全局序列库中进行限制性搜索,获得各谱图的匹配肽段;所述限制性搜索中,以待鉴定谱图的质量为中心,结合肽段的质量误差,确定肽段质量区间;2)根据步骤1)所得各谱图的匹配肽段,构建局部序列库,对于待鉴定谱图数据集的每张谱图,分别在所述局部序列库中进行开放式搜索,获得与一部分谱图相匹配的带修饰的肽段,并获得所带修饰的质量和误差区间;所述开放式搜索中,以待鉴定谱图的质量为中心,结合修饰所引起的肽段质量变化,确定肽段质量区间;3)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图,根据步骤2)所匹配的修饰的质量和误差区间以及当前待鉴定谱图的质量,设定限制性搜索区间,并在全局序列库中进行搜索,获得最终的匹配结果;其中,所述步骤2)包括下列子步骤:21)根据步骤1)所得各谱图的匹配肽段,构建局部序列库,对于待鉴定谱图数据集的每张谱图,分别在所述局部序列库中进行开放式搜索,鉴定出待鉴定谱图数据集中部分带有修饰的肽段;22)对于步骤21)所获得的带有修饰的肽段,在已知的修饰数据库搜索与其匹配的修饰,抛弃无法获得匹配修饰的肽段;23)对经过步骤22)处理的带有修饰的肽段,计算其所带修饰的质量和误差区间。
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