[发明专利]一种在高维数据中快速识别特征组合的方法及系统有效
申请号: | 201410001461.0 | 申请日: | 2014-01-02 |
公开(公告)号: | CN103761426B | 公开(公告)日: | 2017-01-04 |
发明(设计)人: | 王勇 | 申请(专利权)人: | 中国科学院数学与系统科学研究院 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24;G06K9/62 |
代理公司: | 北京君尚知识产权代理事务所(普通合伙)11200 | 代理人: | 余长江 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种在高维数据中快速识别特征组合的方法及系统。该方法及系统一方面最小化由留一法度量的交叉验证分类误差、同时最小化选择特征的个数,最后建模实现高维数据中特征组合的快速识别,为高维数据的统计分析提供了一个快速的解决办法,在数据挖掘、机器学习、人工智能、生物医学等领域有广泛的应用前景。 | ||
搜索关键词: | 一种 数据 快速 识别 特征 组合 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种在高维数据中快速识别特征组合的方法,包括以下步骤:1)获取样本数据;2)根据获取的样本数据,构建特征组合识别的最优化模型,所述模型的优化目标为分类精度最大,同时选择到特征的个数最少,所述特征组合识别的最优化模型为混合整数规划模型,具体为:minxj,γiΣi=1mγi+λΣj=1nxj]]>s.t.Σj=1n|(sij-Σt≠i,st∈Iastj)|xj+ϵ-γi<Σj=1n|(sij-Σst∉Iastj)|xj,forSi∈Ia]]>xj∈{0,1}γi≥0a∈{1,2}其中:模型中的元素sij代表了第i个样本中第j个特征的浓度;Si代表样本i,i=1,2,…,m;j=1,2,…,n,整数变量xj为第j个特征是否被选到最优的特征组合中,如果xj=1,则特征j被选入,否则将不被选入;ε为常数,ε取值为正的充分小的数,其物理意义是精度,a是类别的标签,Ia代表类别a中所有样本的集合,γi是模型引入的松弛变量,用来表示对样本i的分类误差的允许程度,目标来使得最优的特征组合中特征的个数最少,代表总的分类误差,这个作为目标函数,需要在最优化的过程中取得最小值,从而得到的最优解对样本具有最好的分类精度;3)逐个分析单个特征的预测能力,并根据单个特征的预测能力对所有特征进行排序;4)将具有预测能力的特征输入到特征组合识别的最优化模型,固定特征个数为k来求解模型,得到特征数为k的最优的特征组合,将k从1逐渐增长,同时记录分类精度的变化,当分类精度得到最大的时候,得到模型输出的最优的特征组合。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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