[发明专利]稳定的配对E值在审
申请号: | 201380014871.2 | 申请日: | 2013-01-17 |
公开(公告)号: | CN104169928A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
发明(设计)人: | R·A·赫尔曼;P·桑 | 申请(专利权)人: | 陶氏益农公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;G06F19/18 |
代理公司: | 北京市嘉元知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11484 | 代理人: | 张永新 |
地址: | 美国印*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 本发明涉及用于获得稳定并且不依赖蛋白或核酸序列数据库大小的生物信息学配对E值的系统和方法。提供了示例性实施方案,为多蛋白数据中含有的每一个蛋白限定至少一个数据库,并在查询(query)蛋白与每一个单蛋白数据库中的每一个蛋白质之间生成E值,从而为每一个查询-数据库蛋白比较提供一个稳定的配对E值。 | ||
搜索关键词: | 稳定 配对 | ||
【主权项】:
一种用于为查询序列生成稳定的配对E值和/或进行变应原分类的计算机化系统,包括:(a)输入设备和输出设备/界面;(b)与计算机的存储器相连的分析系统界面;(c)包含至少一个数据库的操作系统;(d)稳定配对E值模块;和(e)分类模块。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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