[发明专利]考虑重复性的碱基序列重组系统及方法在审

专利信息
申请号: 201310373186.0 申请日: 2013-08-23
公开(公告)号: CN103793624A 公开(公告)日: 2014-05-14
发明(设计)人: 朴旻胥 申请(专利权)人: 三星SDS株式会社
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 北京铭硕知识产权代理有限公司 11286 代理人: 金光军;韩芳
地址: 韩国*** 国省代码: 韩国;KR
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摘要: 发明公开一种考虑重复性的碱基序列重组系统及方法。根据本发明一个实施例的碱基序列重组系统包括:片段序列生成单元,用于由短片段(read)生成多个片段(fragment)序列;片段序列长度调整单元,从生成的所述多个片段序列当中选择对象碱基序列上的映射重复数超过设定基准值的片段序列,并调整选择的片段序列的长度,直到所述选择的片段序列的映射重复数达到所述基准值以下;比对单元,利用长度得到调整的所述片段序列执行全局比对(Global alignment)。
搜索关键词: 考虑 重复性 碱基 序列 重组 系统 方法
【主权项】:
一种碱基序列重组系统,包括:片段序列生成单元,用于由短片段生成多个片段序列;片段序列长度调整单元,从生成的所述多个片段序列当中选择对象碱基序列上的映射重复数超过设定基准值的片段序列,并调整选择的片段序列的长度,直到所述选择的片段序列的映射重复数达到所述基准值以下;比对单元,利用所述片段序列执行全局比对。
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