[发明专利]基于质谱数据获取生物标志物的方法及装置在审
申请号: | 201310213846.9 | 申请日: | 2013-05-31 |
公开(公告)号: | CN103336915A | 公开(公告)日: | 2013-10-02 |
发明(设计)人: | 刘伟;谢红卫 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军国防科学技术大学 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 李志刚;吴贵明 |
地址: | 410073 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开了一种基于质谱数据获取生物标志物的方法和装置,该方法包括:步骤S1:取与同一疾病相关的n个疾病质谱数据集,并分别对每个疾病质谱数据集中的蛋白进行蛋白质定量,得到n个蛋白质定量结果,n为正整数;步骤S3:将n个蛋白质定量结果分别转换为n组数据,每组数据均在同一数值范围内;步骤S5:将n组数据与对照组进行比较,取与对照组的统计差异概率值小于预设显著阈值的蛋白作为生物标志物。本发明可节约实验成本,并能使得预测疾病的生物标志物更具有通用性和鲁棒性。 | ||
搜索关键词: | 基于 数据 获取 生物 标志 方法 装置 | ||
【主权项】:
一种基于质谱数据获取生物标志物的方法,其特征在于,包括:步骤S1:取与同一疾病相关的n个疾病质谱数据集,并分别对每个疾病质谱数据集中的蛋白进行蛋白质定量,得到n个蛋白质定量结果,所述n为正整数;步骤S3:将所述n个蛋白质定量结果分别转换为n组数据,所述每组数据均在同一数值范围内;步骤S5:将所述n组数据与对照组进行比较,取与所述对照组的统计差异概率值小于预设显著阈值的蛋白作为生物标志物。
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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