[发明专利]用于转录组测序数据的差异表达分析的排序标准化的计算机实施的方法和计算机系统无效
| 申请号： | 201310154254.4 | 申请日： | 2013-04-28 |
| 公开（公告）号： | CN103377317A | 公开（公告）日： | 2013-10-30 |
| 发明（设计）人： | N·S·海米宁;L·P·帕里达 | 申请（专利权）人： | 国际商业机器公司 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18;G06F19/22 |
| 代理公司： | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人： | 张亚非;于静 |
| 地址： | 美国*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 用于转录组测序数据的差异表达分析的排序标准化的计算机实施的方法包括由计算机接收包含转录组测序数据的第一数据集，该第一数据集包含多个基因，且还包含与所述多个基因中的每个关联的各个排序值；基于排序值来给所述多个基因中的每个基因分配排序，以产生第一排序标准化数据集；确定第一排序标准化数据集中的特定基因的第一排序与第二排序标准化数据集中的该特定基因的第二排序之间的改变，该第二排序标准化数据集基于包含转录组测序数据的第二数据集；以及基于确定的排序改变来确定该特定基因是否在第一数据集和第二数据集之间被有差异地表达。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 转录 序数 差异 表达 分析 排序 标准化 计算机 实施 方法 计算机系统 | ||
【主权项】：
一种用于转录组测序数据的差异表达分析的排序标准化的计算机实现的方法，该方法包括：由计算机接收包含转录组测序数据的第一数据集，该第一数据集包含多个基因，且还包含与所述多个基因中的每个关联的各个排序值；基于排序值来给所述多个基因中的每个基因分配排序，以产生第一排序标准化数据集；确定第一排序标准化数据集中的特定基因的第一排序与第二排序标准化数据集中的该特定基因的第二排序之间的改变，该第二排序标准化数据集基于包含转录组测序数据的第二数据集；以及基于确定的排序改变来确定该特定基因是否在第一数据集和第二数据集之间被有差异地表达。
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
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