[发明专利]肠道病毒71型2A蛋白酶的晶体结构及其在药物设计中的应用

摘要

肠道病毒71型2A蛋白酶的晶体结构及其在药物设计中的应用，涉及一种蛋白酶的晶体结构。提供一种肠道病毒71型的2A蛋白酶的晶体结构、底物结合凹槽、底物结合凹槽在药物分子设计中的应用、能与所述底物结合凹槽相互作用的化合物，以及二者相互作用所形成的复合物结构。所述晶体结构由氮端结构域和碳端结构域构成，所述底物结合凹槽具有由第21位组氨酸、第39位天门冬氨酸、第110位半胱氨酸所构成的催化三联体组成的催化活性中心；所述底物结合凹槽包括S4，S3，S2，S1，S1’，S2’和S3’位点在药物分子设计中的应用。所述能够与所述肠道病毒71型2A蛋白酶的底物结合凹槽相互作用的4个小分子化合物。

主权项

肠道病毒71型的2A蛋白酶的晶体结构，其特征在于由氮端结构域和碳端结构域构成；所述氮端结构域具有4个反平行的β‑折叠片，碳端结构域具有6个反平行的β‑折叠桶和1个紧密结合的锌离子；所述肠道病毒71型2A蛋白酶为（a）或（b）中的蛋白质：（a）有以下氨基酸序列的蛋白质：GKFGQQSGAIYVGNFRVVNRHLATHNDWANLVWEDSSRDLLVSSTTAQGCDTIARCNCQTGVYYCNSRRKHYPVSFSKPSLIYVEASEYYPARYQSHLMLAQGHSEPGDAGGILRCQHGVVGIVSTGGNGLVGFADVRDLLWLDEEAMEQ（b）与（a）中氨基酸序列整体相似度在50%以上的蛋白质。