[发明专利]酚对发光菌毒性预测及评估的新型非线性高效模型构建方法及应用有效

专利信息
申请号: 201310007830.2 申请日: 2013-01-09
公开(公告)号: CN103077313A 公开(公告)日: 2013-05-01
发明(设计)人: 周玮;袁哲明;吴树波;代志军;陈渊;韩娜 申请(专利权)人: 湖南农业大学
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 代理人: 汤东凤
地址: 410128 湖南*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开了一种酚对发光菌毒性预测及评估的新型非线性高效模型的构建方法及应用,利用非线性SVR技术对源自现有技术的18个酚类化合物对发光菌的毒性表示为log EC50进行QSAR研究。这项工作的目的是基于低维特征数据和高维特征数据,通过非线性化学计量学工具寻找更合理的特征和更可靠的QSAR模型,并详细分析与毒性相关的最有价值模型及其最关键的分子特征。本发明将为设计对发光菌毒性增强或减弱的酚类似物提供有效的理论参考。
搜索关键词: 发光 毒性 预测 评估 新型 非线性 高效 模型 构建 方法 应用
【主权项】:
1.一种酚对发光菌毒性预测及评估的新型非线性高效模型的构建方法,其特征在于,1)构建信息全面的数据集:包括因变量Log EC50 (expt.)、高维自变量、低维因变量log Kow、μ和q-、高维自变量通过PCLIENT软件计算而来;2)特征的非线性筛选:高维数据利用HDSN方法筛选特征,将高维数据变成低维数据,低维数据进一步利用WDEM方法筛选特征,最后保留的特征用来建模;3)非线性模型的构建和评估:基于包含关键特征的低维数据集和非线性的SVR方法,构建出20个高预测精度的非线性评估模型, SVR2模型MSE=0.017;=0.921;特征数目=10最优,所述模型中的10个特征及其效应如下:PJI2差异显著, MATS3v差异显著, H1p差异显著, Mor02v差异显著, Mor14p差异显著, Mor02u差异显著, RDF040v差异显著, Mor23v差异显著和MATS1m差异。
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