[发明专利]开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统有效
| 申请号： | 201210451907.0 | 申请日： | 2012-11-12 |
| 公开（公告）号： | CN103810200A | 公开（公告）日： | 2014-05-21 |
| 发明（设计）人： | 迟浩;孙瑞祥;王乐珩;张文力;贺思敏 | 申请（专利权）人： | 中国科学院计算技术研究所 |
| 主分类号： | G06F17/30 | 分类号： | G06F17/30 |
| 代理公司： | 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 | 代理人： | 梁挥;祁建国 |
| 地址： | 100190 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明有关于一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，输入蛋白质序列，模拟切分每一条蛋白质序列，并将所有生成的子序列按照质量排序，生成肽序列数据表，并根据该肽序列数据表建立索引文件；步骤2，输入质谱图，对每张质谱图，提取谱峰生成查询集合，查询所述索引文件，得到序列集合；步骤3，对每张质谱图及其对应的序列集合，根据修饰组合，生成候选肽段并打分；步骤4，对打分结果进行整合，并进行肽段到蛋白质的推断，得到鉴定结果。本发明允许用户不指定酶切和修饰的类型，或指定其中的任意类型进行蛋白质鉴定，用于解决任意类型的酶切和修饰的鉴定问题。 | ||
| 搜索关键词： | 开放式 蛋白质 鉴定 数据库 搜索 方法 及其 系统 | ||
【主权项】：
一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法，其特征在于，包括：步骤1，输入蛋白质序列，模拟切分每一条蛋白质序列，并将所有生成的子序列按照质量排序，生成肽序列数据表，并根据该肽序列数据表建立索引文件；步骤2，输入质谱图，对每张质谱图，提取谱峰生成查询集合，查询所述索引文件，得到序列集合；步骤3，对每张质谱图及其对应的序列集合，根据修饰组合，生成候选肽段并打分；步骤4，对打分结果进行整合，并进行肽段到蛋白质的推断，得到鉴定结果。
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