[发明专利]基因序列数据的处理方法和装置有效

专利信息
申请号: 201210147222.7 申请日: 2012-05-11
公开(公告)号: CN102841987A 公开(公告)日: 2012-12-26
发明(设计)人: 王垚燊;阮航;李萌 申请(专利权)人: 北京诺禾致源生物信息科技有限公司
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 吴贵明;余刚
地址: 100083 北京市海*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种基因序列数据的处理方法和装置。其中,基因序列数据的处理方法包括:接收初始基因序列的测序数据;构建测序数据的德布鲁因图;保存德布鲁因图中的第一边序列和组成第一边序列的各个短序列;获取组成第一边序列的各个短序列的深度信息;根据组成第一边序列的各个短序列的深度信息计算第一边序列的深度信息;按照德布鲁因图中的各个边序列的深度信息和测序数据中的各个短序列化简德布鲁因图;以及切割化简后的德布鲁因图,得到测序数据的叠连群基因序列。通过本发明,解决了现有技术中基因序列数据的处理方法容易造成的生物信息缺失的问题,进而达到了提高基因序列组装的有效性的效果。
搜索关键词: 基因 序列 数据 处理 方法 装置
【主权项】:
一种基因序列数据的处理方法,其特征在于,包括:接收初始基因序列的测序数据;构建所述测序数据的德布鲁因图;保存所述德布鲁因图中的第一边序列和组成所述第一边序列的各个短序列,其中,所述第一边序列为所述德布鲁因图中的任一边序列;获取组成所述第一边序列的各个短序列的深度信息;根据组成所述第一边序列的各个短序列的深度信息计算所述第一边序列的深度信息;按照所述德布鲁因图中的各个边序列的深度信息和所述测序数据中的各个短序列化简所述德布鲁因图;以及切割化简后的德布鲁因图,得到所述测序数据的叠连群基因序列。
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