[发明专利]有机污染物定量结构活性相关建模的变量筛选方法有效

专利信息
申请号: 201210137589.0 申请日: 2012-05-03
公开(公告)号: CN102682209A 公开(公告)日: 2012-09-19
发明(设计)人: 易忠胜;刘红艳;莫凌云 申请(专利权)人: 桂林理工大学
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 541004 广西壮族*** 国省代码: 广西;45
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摘要: 发明公开了一种有机污染物定量结构活性相关建模的变量筛选方法。首先计算全部的单变量和不同双变量组合的线性模型,二者均保留一定数量的最优模型。然后从保留的双变量线性模型中依次取出一个模型,将其中的两个变量与余下的变量中每一个变量分别组成三变量模型;直到所有保留的双变量模型处理完成,然后比较这些三变量模型的优劣,保留一定数量的最优三变量模型。依此类推,计算到构成模型的变量数满足要求时,停止计算。其中模型的优劣以Leave-One-Out Cross Validation(LOOCV)或者Leave-Multiple-Out Cross Validation(LMOCV)计算的q2或者均方根差RMSEV为终止标准。本发明原理简单,易于理解,容易编程实现,方法快速有效,保障了变量筛选的合理性以及模型的稳定性和预测能力。
搜索关键词: 有机 污染物 定量 结构 活性 相关 建模 变量 筛选 方法
【主权项】:
一种有机污染物定量结构活性相关建模的变量筛选方法,其特征在于具体步骤为:(1)、单变量模型计算过程如下:按照变量顺序,依次取一个变量,即模型变量数Vn=1,建立一元线性模型,计算其相关系数r2,如果相关系数大于给定的临界值rcri,则进行LOOCV或者LMOCV计算,否则选取下一个变量建立一元线性模型,并保留预先设定的Ns个最优的模型,包括模型的变量,r2、q2、RMSEE和RMSEV等统计参数;直到所有变量计算完成;(2)、双变量模型计算过程如下:从所有两个变量的组合中依次选取一个,即模型变量数Vn=2,建立二元线性模型,计算其复相关系数r2,如果相关系数大于给定的临界值rcri,则进行LOOCV或者LMOCV计算,否则选取下一个双变量组合建立二元线性模型,并保留预先设定的Ns个最优的模型,包括模型的变量,r2、q2、RMSEE和RMSEV等统计参数;直到所有变量计算完成;(3)、三个及三个以上变量模型计算过程如下:三个及三个以上变量模型的变量数Vn≥3,从保留的Ns个变量数为Vn‑1的模型中选取一个模型,以该模型中的变量为基础,从余下的变量中每次选择一个变量与原来的Vn‑1个变量构成变量数为Vn的变量组合,建立Vn元的线性模型,计算其复相关系数r2,如果相关系数大于给定的临界值rcri,则进行LOOCV或者LMOCV计算,否则选取下一个变量组合,建立Vn元线性模型,直到所有变量计算完成;接着选取下一个变量数为Vn‑1的模型,重复以上过程,直到保留的Ns变量数为Vn‑1的模型全部处理完成;然后进行变量数为Vn+1的变量筛选,直到变量数满足要求或者变量数大于样本的5倍为止;并保留预先设定的Ns个最优的模型,包括模型的变量,r2、q2、RMSEE和RMSEV等统计参数。
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