[发明专利]相互作用力变化预测装置和相互作用力变化预测方法

摘要

相互作用力变化预测装置(100)具备：结合3残基组数据作成部(211)，制作3残基组的结合3残基组数据，该3残基组表示1对氨基酸残基对、与氨基酸残基对中的一个氨基酸残基相邻的1个氨基酸残基；突变后3残基组数据作成部(212)，制作突变后的3残基组的突变后3残基组数据；相互作用分值算出部(213)，参照3残基组表(151)，计算出由结合3残基组数据所示的3残基组的结合相互作用分值和由突变后3残基组数据所示的3残基组的突变后相互作用分值；相互作用力变化预测值算出部(214)，计算出结合相互作用分值和突变后相互作用分值的差分。

主权项

一种相互作用力变化预测装置，用于预测对蛋白质施加突变前后的2个蛋白质间的相互作用力的变化，所述相互作用力变化预测装置的特征在于，具备：结合3残基组数据作成部，参照表示构成发生相互作用的2个蛋白质的原子的位置的复合体立体结构信息，取得多个3残基组，并制作表示取得的多个所述3残基组的结合3残基组数据，所述3残基组表示在所述2个蛋白质的结合部位在一定距离内接近的1对氨基酸残基对、和与所述氨基酸残基对中的一个氨基酸残基在氨基酸序列上相邻的N末端侧或C末端侧的1个氨基酸残基；突变后3残基组数据作成部，参照表示施加突变的蛋白质的氨基酸残基的位置和突变后的氨基酸残基的种类的突变信息，分别关于所述结合3残基组数据所示的多个所述3残基组，制作突变后3残基组数据，所述突变后3残基组数据表示将所述施加突变的蛋白质的氨基酸残基的位置的氨基酸残基的种类取代为所述突变后的氨基酸残基的种类后的3残基组；相互作用分值算出部，参照3残基组表，算出作为由所述结合3残基组数据所示的多个所述3残基组的相互作用力的平均值的结合相互作用分值、和作为由所述突变后3残基组数据所示的多个所述3残基组的相互作用力的平均值的突变后相互作用分值，所述3残基组表是表示任意3个氨基酸残基的种类的3残基组文字列、和表示由所述3残基组文字列所示种类的3个氨基酸残基在2个蛋白质的结合部位构成所述3残基组时的相互作用力的3残基组分值对应的数据；相互作用力变化预测值算出部，作为用于预测施加由所述突变信息所指定的突变前和施加所述突变后的所述2个蛋白质间的相互作用力的变化的相互作用力变化预测值，算出所述结合相互作用分值和所述突变后相互作用分值的差分。