[发明专利]基因聚类程序、基因聚类方法及基因聚类分析装置无效
| 申请号： | 200980147398.9 | 申请日： | 2009-12-01 |
| 公开（公告）号： | CN102227731A | 公开（公告）日： | 2011-10-26 |
| 发明（设计）人： | 纳塔利娅·波卢利亚赫;理查德·诺克;弗兰克·尼尔森;北野宏明 | 申请（专利权）人： | 索尼公司 |
| 主分类号： | G06F19/24 | 分类号： | G06F19/24 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 余刚;吴孟秋 |
| 地址： | 日本*** | 国省代码： | 日本;JP |
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| 摘要： | 本发明要提供一种基因聚类工具，其无需先验数据预测，就能够基于基因表达量随时间变化的数据进行高精度的基因聚类。本发明提供了一种基因聚类程序，用于至少执行以下步骤：步骤S1，基于表示基因表达量随时间的变化的数据计算反映数据间相似性的特征值；步骤S2，基于算出的特征值对所有基因组合计算相似性矩阵M的本征向量；步骤S3，在保持本征向量的本征值的同时将相似性矩阵M转换成布尔矩阵N；以及步骤S4，基于布尔矩阵N聚类数据。 | ||
| 搜索关键词： | 基因 程序 方法 聚类分析 装置 | ||
【主权项】：
一种基因聚类程序，用于至少执行以下步骤：步骤(1)，基于表示基因表达量随时间的变化的数据计算反映数据间相似性的特征值；步骤(2)，基于算出的特征值对所有基因组合计算相似性矩阵M的本征向量；步骤(3)，在保持本征向量的本征值的同时将相似性矩阵M转换成布尔矩阵N；以及步骤(4)，基于布尔矩阵N聚类数据。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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