[发明专利]一种与银屑病密切相关联的易感基因区域及用于检测银屑病易感人群的方法

摘要

本发明涉及一种与银屑病密切相关联的易感基因区域及用于检测银屑病易感人群的方法，该区域内含有LCE3A，LCE3B，LCE3C，LCE3D，LCE3E，LCE2C，LCE2D七个基因，该区域用于检测银屑病易感人群的方法是通过以下步骤实现：基因组DNA提取；PCR扩增；使用SAP碱性磷酸酶进行纯化；使用根据这一区域内SNP位点设计的UEP引物进行SNP位点的单碱基延伸反应；使用质谱仪进行扫描，根据各单碱基延伸产物的分子量的不同判断这一易感基因区域内SNP位点的差异；结果判定。本发明揭示与银屑病密切相关联的易感基因区域；并通过该易感基因区域的遗传特性提出一种准确、有效判定银屑病易感人群的方法。

主权项

1、一种与银屑病密切相关联的易感基因区域，其特征在于该区域内含有LCE3A，LCE3B，LCE3C，LCE3D，LCE3E，LCE2C，LCE2D七个基因，这一区域内位于LCE3A基因上的rs1886734多态性位点为G，rs4845454多态性位点为T，rs1011297多态性位点为C，rs4845457多态性位点为T，rs6687682多态性位点为T，rs1325508多态性位点为G，以及由位于此基因上的SNP位点rs1886734，rs4845454，rs1011297，rs4845457，rs6687682，rs11205050，rs1325508组成的单倍型GTCTTA6，GTCTTAG，GTTCCGA的个体；位于LCE3D基因上的rs4845445多态性位点为T，rs4085613多态性位点为C，rs4112788多态性位点为C，rs11810844多态性位点为T，rs4112789多态性位点为T，以及由位于该基因上的SNP位点rs12046030，rs4845445，rs16834214，rs4085613，rs4112788，rs11810844，rs4112789组成的单倍型ATCCCTT，CCTCCTT，CTTCCCC的个体；位于LCE2C基因上的rs1925661多态性位点为A，以及由位于该基因上的SNP位点rs1925661，rs6701538组成的单倍型AA，AG的个体；位于LCE2D基因上的rs942826多态性位点为T，rs1325507多态性位点为T，rs908929多态性位点为G，rs1332497多态性位点为C，rs11205062多态性位点为A，以及由位于该基因上的SNP位点rs942826，rs1325507，rs908929，rs1332497，rs11205062组成的单倍型TTGCA的个体；位于LCE3E基因上的rs7516108多态性位点为C，以及由位于该基因上的SNP位点rs533917，rs7530609，rs4240887，rs4845790，rs4845791，rs4845792，rs17659389，rs7516108组成的单倍型ACACGGAC的个体。