[发明专利]一种与银屑病密切相关联的易感基因区域及用于检测银屑病易感人群的方法

说明书

技术领域

本发明涉及分子遗传学和皮肤病学领域。具体的说，本发明涉及一个与银屑病有密切关联的易感基因区域已经用于检测银屑病易感人群的方法。

背景技术

在皮肤病领域，银屑病(psoriasis)是一种常见的以红斑，鳞屑为主要表现的，最为常见的慢性复发性复杂疾病，被世界卫生组织列为20世纪人类皮肤病领域两大顽症之一，本病发病率在白种人中高达2％，而在中国人群中为0.123％，国内约有500万的个体罹患，并以每年净增10万病例的速度递增。银屑病该病俗称“牛皮癣”，易复发难根治并且迁延不愈，而且患者容易出现关节损害，造成运动障碍。随着社会经济的日益发展，皮肤病的危害越来越受到社会各界的关注，广大患者迫切需要得到有效的治疗。目前认为银屑病是遗传与环境相互作用的多基因病，其中遗传因素在银屑病的发病中起到重要作用。因此，银屑病易感基因的研究是阐明银屑病致病机理最重要的线索。

迄今为止，在复杂疾病及其复杂生理过程相关基因的识别和定位方面取得的成绩尚不明显。原因主要在于复杂疾病具有较强的遗传异质性，遗传模式的不确定性，环境和基因的交互作用的复杂性，辅以目前对于复杂疾病认识的局限性等。随着科技的进步，人们越来越认识到基因缺陷是许多复杂疾病产生的重要原因，人在遇到心理和社会环境压力时，那些携带疾病易感基因的人比不携带疾病易感基因的人更可能罹患银屑病。遗传因素还基本上得到家系、双生子及寄养子的流行病学调查结果的支持。在科技日益发展的今天，如何从遗传角度检测易感基因以及个体的疾病易感性，以至于进行进一步风险预测和诊断，成为广大皮肤科技人员和医疗卫生人员面临的严峻问题。尽管国内外疾病易感基因研究开展多年，但尚未取得突破性进展，鲜有价值的研究结果。对于怎样鉴定遗传易感基因以及鉴定试验者的遗传易感性，本领域一直缺乏全面、系统、有效的识别方法。

发明内容

本发明的目的之一是揭示与银屑病密切相关联的易感基因区域；目的之二是通过该易感基因区域的遗传特性提出一种判定银屑病的易感人群的方法。

本发明是通过以下技术方案实现的：

一种与银屑病密切相关联的易感基因区域，该区域内含有LCE3A，LCE3B，LCE3C，LCE3D，LCE3E，LCE2C，LCE2D七个基因，这一区域内位于LCE3A基因上的rs1886734多态性位点为G，rs4845454多态性位点为T，rs1011297多态性位点为C，rs4845457多态性位点为T，rs6687682多态性位点为T，rs1325508多态性位点为G，以及由位于此基因上的SNP位点rs1886734，rs4845454，rs1011297，rs4845457，rs6687682，rs11205050，rs1325508组成的单倍型GTCTTAG，GTCTTAG，GTTCCGA的个体；位于LCE3D基因上的rs4845445多态性位点为T，rs4085613多态性位点为C，rs4112788多态性位点为C，rs11810844多态性位点为T，rs4112789多态性位点为T，以及由位于该基因上的SNP位点rs12046030，rs4845445，rs16834214，rs4085613，rs4112788，rs11810844，rs4112789组成的单倍型ATCCCTT，CCTCCTT，CTTCCCC的个体；位于LCE2C基因上的rs1925661多态性位点为A，以及由位于该基因上的SNP位点rs1925661，rs6701538组成的单倍型AA，AG的个体；位于LCE2D基因上的rs942826多态性位点为T，rs1325507多态性位点为T，rs908929多态性位点为G，rs1332497多态性位点为C，rs11205062多态性位点为A，以及由位于该基因上的SNP位点rs942826，rs1325507，rs908929，rs1332497，rs11205062组成的单倍型TTGCA的个体；位于LCE3E基因上的rs7516108多态性位点为C，以及由位于该基因上的SNP位点rs533917，rs7530609，rs4240887，rs4845790，rs4845791，rs4845792，rs17659389，rs7516108组成的单倍型ACACGGAC的个体。

一种与银屑病密切相关联的易感基因区域用于检测银屑病易感人群的方法，其特征是通过以下步骤实现：

(1)基因组DNA提取，用微量DNA提取试剂盒提取基因组DNA；

(2)PCR扩增这一区域内含SNP位点的目的片段；

(3)使用SAP碱性磷酸酶进行纯化，去除未反应完的dNTP等物质；