[发明专利]基于计算机分析来改良菌株的方法

摘要

本发明涉及一种基于计算机分析来改良菌株的方法，其中将用于生产有用物质的靶菌株基因组信息与用于过量生产有用物质的菌株基因组信息相比对，以便初筛出对于过量生产有用物质来说不必要的基因，然后利用代谢流分析通过模拟来二次筛选出要去除的基因。根据本发明，通过代谢和遗传工程方法可以有效地构建改良的菌株，包括比对分析靶菌株用于生产有用物质的基因组信息和生产大量有用物质的菌株基因组信息以筛选出候选基因，并在筛选的候选基因上进行计算机模拟以选出要去除的基因组合，这表现出有用物质产量的提高。因此，可以显著减少实际试验所需的时间、精力和成本。

主权项

1.一种用于改良生产有用物质的菌株的方法，该方法包括以下步骤：(a)选择用于生产有用物质的靶菌株和过量生产有用物质的菌株，并构建两种菌株的代谢流分析模型系统；(b)筛选存在于生产有用物质的靶菌株中而不存在于过量生产有用物质的菌株中并且对于细胞生长来说是不必要的或者不会造成干扰的基因；(c)由筛选出的基因构建出要去除的基因组合；(d)利用步骤(a)中构建的代谢流分析模型系统，通过从上述生产有用物质的靶菌株中去除步骤(c)中构建的各基因组合从而获得突变菌株，在该突变菌株上进行计算机模拟；(e)从模拟结果中选出要去除的基因组合，其具有优异的有用物质产量与比生长速率；(f)构建去除了选择基因组合的突变菌株。