[发明专利]筛选核苷酸序列的计算机系统和方法无效
申请号: | 200410005215.9 | 申请日: | 2004-02-17 |
公开(公告)号: | CN1525362A | 公开(公告)日: | 2004-09-01 |
发明(设计)人: | 涩谷哲朗 | 申请(专利权)人: | 国际商业机器公司 |
主分类号: | G06F17/50 | 分类号: | G06F17/50 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 吴丽丽 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 本发明提供了一种筛选核苷酸序列的计算机系统和方法,这种方法包括下列步骤:存储靶核苷酸序列数据和一个探针核苷酸序列(S10);根据一个可能与靶核苷酸序列结合的探针核苷酸序列产生互补序列数据和存储靶核苷酸序列与探针核苷酸序列之间最大可接受编辑距离(S12);从每个存储单元读出每个核苷酸序列数据和最大编辑距离,以编辑距离递降次序鉴定靶核苷酸序列数据与互补序列数据的结合可能性(S14);以及将结合鉴定结果存储在一个存储单元内(S16)。 | ||
搜索关键词: | 筛选 核苷酸 序列 计算机系统 方法 | ||
【主权项】:
1.一种筛选核苷酸序列的计算机系统,所述计算机系统包括:一个存储靶核苷酸序列数据的靶核苷酸序列存储单元;一个根据一个可能与靶核苷酸序列结合的探针核苷酸序列产生互补序列数据和存储所产生的互补序列数据的互补序列数据存储单元;一个以编辑距离递降次序鉴定所述靶核苷酸序列数据和所述互补序列数据、确定所述探针核苷酸序列与所述靶核苷酸序列的结合可能性的鉴定处理单元;以及一个存储所述鉴定处理单元得到的鉴定结果的存储单元。
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