本发明属于水稻基因工程技术领域，公开了水稻稻瘟病抗性基因Pik‑W25及其应用，该基因包括Pik‑W25‑1和Pik‑W25‑2，Pik‑W25‑1和Pik‑W25‑1的蛋白序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，编码蛋白的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示。抗谱分析表明，Pik‑w25对不含无毒基因Avr‑Pik菌株敏感，对含有AvrPik‑D的菌株显示抗病，这与其他Pik等位基因一致。更重要的是，将AvrPik‑C、AvrPik‑D和AvrPik‑E转入到菌株R88002(该菌株不含有任何AvrPik单倍型)后，转基因菌株对Pik‑W25不能致病，这表明Pik‑W25可识别AvrPik‑C、AvrPik‑D和AvrPik‑E并引发抗病性。从这些数据我们可以得出结论，Pik‑W25是Pik一个等位基因。通过序列比对，我们发现Pik‑W25的序列是K1和K2的嵌合体，此前从未报道过。同时，对AvrPik‑C的抗性使Pik‑W25成为一种不可替代的Pik等位基因，可用于水稻育种中提高对稻瘟病的抗性。
