“陆妙善”申请（专利权）人搜索_中国专利权人_发明人_技术持有人_科研专家_钻瓜专利网

钻瓜专利网为您找到相关结果4个，建议您升级VIP下载更多相关专利

[发明专利]一种使用列式存储和压缩技术的质谱数据格式生成方法-CN202310928313.2在审
发明人：于长斌;陆妙善;童俊杰 -专利权人：碳硅（杭州）生物科技有限责任公司
申请日： 2023-07-27 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G06F16/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种使用列式存储和压缩技术的质谱数据格式生成方法，包括以下步骤：S1，分割原始文件为一级谱图块和二级谱图块数据；S2，DIA采集模式下提取所有谱图块，DDA采集模式下仅提取一级谱图块的质荷比与强度数组，DDA模式下的二级谱图块保持原有的存储方式不变；S3，通过列式存储转换算法转换得到光谱序列数组和转换后的强度数组；同时进行质荷比数组去重；S4，将光谱序列数组、转换后的强度数组、去重质荷比数组、保留时间数组压缩得到压缩字节，保存Aird文件；S5，构建索引信息并保存列索引文件；S6，索引信息及元数据用于构建并保存行索引文件；S7，Aird文件、列索引文件及行索引文件合成Aird文件文件集。大大提高了数据读取的效率。
一种使用存储压缩技术数据格式生成方法

[发明专利]一种面向质谱数据的具有动态决策器的组合压缩方法-CN202211522575.0在审
发明人：于长斌;陆妙善;童俊杰 -专利权人：碳硅（杭州）生物科技有限责任公司
申请日： 2022-11-30 - 公布日： 2023-03-24 - 主分类号： H03M7/30 文献下载
摘要：本发明提供一种面向质谱数据的具有动态决策器的组合压缩方法，包括以下步骤：S1从需要测试的每一个质谱文件中随机挑选多张谱图数据，将若干个维度数据进行提取，保存为浮点型的数组，使用变换编码将其转换为整数型数组；S2将整数型数组进行组合压缩测试；S3通过不同组合压缩器压缩后的数组会进入动态决策器的打分系统，对每一种压缩器组合的性能进行评估；S4将满足上述条件的所有不同组合压缩器的得分进行计算和排序，分数最优的组合压缩器会被预测选定为最佳组合压缩器使用。该发明的优点在于：该预测组合与实际进行数据集在所有排列组合压缩测试下的最佳压缩器组合一致。同时，本发明创造的算法可以针对不同维度的数据采取不同的压缩策略。
一种面向数据具有动态决策组合压缩方法

[发明专利]一种全新的质谱压缩方法、存储介质及计算机系统-CN202210527894.4在审
发明人： 陆妙善;王金银;于长斌 -专利权人：碳硅（杭州）生物科技有限责任公司
申请日： 2022-05-16 - 公布日： 2022-10-18 - 主分类号： H03M7/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种全新的质谱压缩方法、存储介质及计算机系统，其中方法包括以下步骤：S1，采集厂商质谱数据；S2，将采集到的数据切分为质谱元数据和和核心质谱数据，核心质谱数据包括质荷比数组和强度数组；S3，使用SZDPD算法对核心质谱数据进行压缩；S4，将压缩后的二进制数组输出为aird格式的二进制文件，并构建多策略索引模型；S5，根据多策略索引模型生成json格式的多策略质谱元数据；aird格式二进制文件和json格式的元数据文件即为aird格式文件。本发明较现有的压缩算法，压缩效果有很大提升，大幅降低带宽和运算内存的要求，使蛋白质组学的数据分析可在一台普通台式机上进行。
一种全新压缩方法存储介质计算机系统

[发明专利]一种质谱数据压缩方法-CN202110921939.1在审
发明人： 陆妙善;王瑞敏;安绍维 -专利权人：碳硅（杭州）生物科技有限责任公司
申请日： 2021-08-12 - 公布日： 2021-11-16 - 主分类号： G16B50/50 文献下载
摘要：一种质谱数据压缩方法，包括以下步骤：S1、将原始数据文件进行切分为质谱数据和基础元数据，其中质谱数据包括质核比数组和强度数组，质核比数组与强度数组长度相同并且一一对应；S2、质核比数组和强度数组在ZDPD压缩内核中压缩成为二进制数据；同时质谱的基础元数据信息以JSON格式保存；S3、对步骤S2中使用ZDPD进行压缩内核时产生的二进制数组直接输出为质谱数据Aird格式文件，同时在压缩数据时,将质谱仪在数据依赖模式/数据非依赖模式/PRM模式/传统模式的多策略索引下生成的相关基础索引数据并入到步骤S2中的JSON格式元数据中，形成完整的元数据格式JSON文件。本发明搭建了大型的蛋白质组学数据中心,实现了一套自研的面向计算的高性能数据格式。
种质数据压缩方法