用于治疗革兰氏阴性菌相关感染的药物组合物包括抗菌蛋白,所述抗菌蛋白包括选自以下组的至少一种蛋白质:具有如SEQ ID NO:1所示氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:3所示氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:4所示氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:6所示氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:7所示氨基酸序列的蛋白质、具有如SEQ ID NO:8所示氨基酸序列的蛋白质。还公开了一种制备抗菌蛋白的方法。