本发明公开了一种与黑鲷生长性状相关的SNP分子标记,所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示。所述SEQ ID NO.1自5’端起第276位碱基为T或C,基因型为TT的个体生长速度显著高于CC和TC个体;所述SEQ ID NO.2自5’端起第364位碱基为A或C,基因型为AA的个体生长速度显著高于CC和AC个体;所述SEQ ID NO.3自5’端起第6070位碱基为A或T,基因型为TT的个体生长速度显著高于AA和AT个体。本发明所发现的3个SNP分子标记可快速获得生长速度快且遗传稳定的黑鲷个体,可应用于选育出具有快速生长的黑鲷品种。