本发明涉及Crtc2/Creb复合物阻断多肽及其衍生药物多肽和应用,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示,可以用于制备治疗肥胖、脂肪肝、高脂血症和2型糖尿病药物。所述的药物多肽包括靶向抑制Crtc2/Creb复合物形成的阻断功能结构域和穿膜功能结构域,所述靶向抑制Crtc2/Creb复合物形成的阻断功能结构域氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。上述药物多肽具备显著的调节血糖、血脂以及抑制肝脏脂质沉积的作用,可以单独作为治疗肥胖、脂肪肝和2型糖尿病等代谢疾病的治疗药物或辅助其他治疗方式进行治疗。