本发明公开了一种pCasRA质粒,所述pCasRA质粒的核苷酸信息如SEQ ID NO:1所示。所述pCasRA质粒以pCas9质粒作为载体骨架,在载体骨架上接入接合转移位点oriT、pRA0726质粒的复制子和头孢西丁抗性基因,并将pCas9质粒中的crRNA部分替换成Cas9蛋白基因(SEQ ID NO:20)和整合型sgRNA(SEQ ID NO:7)的连接产物。本发明所述pCasRA质粒能够在大肠杆菌中通过接合转移到鸭疫里氏杆菌中,并且该pCasRA质粒能够在鸭疫里氏杆菌中稳定表达Cas9蛋白基因,进行基因组DNA编辑,实现基因敲除和/或单碱基突变。
本发明公开了一种基于RPA‑CRISPR‑Cas12a可视化检测鸭疫里氏杆菌的试剂盒及其应用,所述试剂盒包含特异性crRNA、鸭疫里氏杆菌特异性RPA引物对和探针,所述特异性crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述特异性RPA引物对的上游引物RPA‑F、下游引物RPA‑R和探针的核苷酸序列依次如SEQ ID NO:3~5所示;探针5’端标记荧光基团,3’端标记淬灭基团。所述试剂盒具有成本低,操作便捷、耗时少、灵敏度高和特异性强等特点,全程在37~40℃环境下进行,可以有效脱离实验室大型仪器的依赖。