本发明公开了一种机采系统效率软测量方法,该方法包括:步骤1:采集多台抽油机井的井矿数据作为建模样本数据;步骤2:对步骤1中的建模样本数据进行预处理;步骤3:对预处理后的所有样本数据进行局部线性嵌入(Local Linear Embedded,LLE)特征提取,并得到低维特征向量;步骤4:栈式自编码(Stack Auto‑Encoder,SAE)神经网络方法建立软测量模型。本发明针对现有机采系统效率计算时依赖参数较多,某些参数难以测量,且机采系统效率与各参数之间存在非线性关系的问题,可以提高预测模型的容变性及稳健性。