本发明公开了抗菌肽及其制备方法和应用,属于生物技术领域。本发明公开深海热液虾抗菌肽,其包括两条Type IIa型抗菌肽Al‑crus 3和Al‑crus 7,所述Al‑crus 3的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述Al‑crus 7如SEQ ID NO:2所示。本发明获得的抗菌肽基因序列是宝贵的深海生物基因资源,其对部分病原菌和致病菌有明显的抑制作用,尤其是对耐药菌甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌和耐亚胺培南鲍曼不动杆菌有明显的抑制效果,且易体外表达获取,可为后续深海基因的研究和利用提供理论基础,为替代抗生素提供新的方向。