本发明涉及一种利用亚端粒序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法，包括根尖细胞玻片制备、标记探针制备、根尖玻片预处理、配制变性杂交混合液、变性杂交混合液与预处理根尖玻片的杂交。若杂交玻片上产生绿色荧光信号，则判定该待测样品包含斑茅血缘，为甘蔗与斑茅真实杂交后代。所述产生绿色荧光信号探针的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列。本发明结合荧光原位杂交技术，利用斑茅相对甘蔗特异的亚端粒序列探针来鉴别甘蔗与斑茅的真实杂交后代，具有效率高，灵敏性好，稳定性好，可靠性高的特点，只需获得蔗苗的根尖就能够检测较高杂交世代的真实性，为在甘蔗遗传育种改良过程中斑茅的杂交利用提供稳定有效的鉴别方法。
本发明涉及一种利用散布序列鉴定甘蔗中包含斑茅血缘的方法，包括根尖细胞玻片制备、标记探针制备、根尖玻片预处理、配制变性杂交混合液、变性杂交混合液与预处理根尖玻片的杂交。若杂交玻片上产生绿色荧光信号，则判定该待测样品包含斑茅血缘，为甘蔗与斑茅真实杂交后代。所述产生绿色荧光信号的是探针，其核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列。本发明结合荧光原位杂交技术，利用斑茅相对甘蔗特异的散布序列探针来鉴别甘蔗与斑茅的真实杂交后代，具有效率高，灵敏性好，稳定性好，可靠性高的特点，只需获得蔗苗的根尖就能够检测任何杂交世代的真实性，为在甘蔗遗传育种改良过程中斑茅的杂交利用提供高效稳定的鉴别方法。
本发明涉及一种在染色体悬浮液中进行基因组原位杂交（Genome in situ hybridization in suspension,GISHIS）的方法，包括细胞周期同步化、染色体悬浮液制备、基因组探针制备、样品与基因组探针变性、悬浮液中进行基因组原位杂交。滴片镜检，若悬浮液中产生绿色荧光信号，则判定为斑茅染色体，说明成功将绿色荧光标记到斑茅染色体上了。利用流式细胞仪，可以对染色体悬浮液中特异标记绿色荧光信号的斑茅染色体实现分选并进行相关测序研究，为研究复杂多倍体斑茅基因组提供了新的、有效可行的方法。本发明可应用于各种作物中属间杂交后代的染色体悬浮液中进行基因组原位杂交。
