本发明涉及多肽提取技术领域,尤其涉及黄芪多肽的制备方法及其在制备化妆品中的应用。本发明提供的方法将黄芪粉碎后,经超临界二氧化碳流体处理,再以裂解液进行裂解后,过滤取滤液;所述滤液依次经盐析、清洗、烘干、研磨、酶解、脱色、超滤,获得黄芪多肽。该方法合理控制了提取步骤中的各个参数,从而使得多次提取的结果保持一致。通过对分子量进行控制,获得了具有良好生理功能以及渗透效果的黄芪多肽。实验表明,本发明提供的黄芪多肽能够抑制MMPs的表达,促进Tolloid‑like protein 1 precursor的表达,且渗透效果良好。