本发明公开了Rae1‑Nup98特异性结合多肽及其应用。具体地公开了氨基酸序列是SEQ ID No.1的特异性结合人源Rae1‑Nup98蛋白的ORF6‑C3Q56E多肽。本发明提供了人源Rae1‑Nup98蛋白克隆及表达的方法，以及ORF6多肽与Rae1‑Nup98共结晶的方法，通过结构生物学方法确定了ORF6多肽与Rae1‑Nup98相互作用的氨基酸位点，从而发现并设计了ORF6‑C3Q56E多肽，其与Rae1‑Nup98的亲和力提升了6倍，在新冠病毒感染后期机体的免疫过激或炎症反应过度的时候可以用于拮抗干扰素信号的传递，调节并减轻机体的症状。
本发明公开了TOM70蛋白特异性结合多肽及其应用。本发明具体地公开了氨基酸序列是SEQ ID No.1的特异性结合人源TOM70蛋白的orf9b多肽。本发明提供了人源TOM70(106‑608)蛋白以及SARS‑CoV‑2orf9b蛋白的克隆及表达的方法，以及orf9b蛋白与TOM70(106‑608)共结晶的方法，通过结构生物学方法发现了小分子多肽orf9b，本发明orf9b多肽可以特异性结合TOM70蛋白别构抑制Hsp90与TOM70的结合，为设计新型抗新冠病毒药物提供最为直接的药物筛选平台，为抗新冠病毒药物的研发提供新的方向。
