本发明公开了一种用于快速鉴定玉米单倍体的荧光诱导系构建的标记基因,其核酸分子为如下(a)或(b)或(c)的基因:(a)其编码序列是SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2所示的cDNA分子或基因组DNA分子;(b)与(a)限定的任一核苷酸序列具有75%或75%以上同一性;(c)在严格条件下与(a)或(b)限定的核苷酸杂交,且任一基因在玉米胚中表达量高,而在胚乳中表达量低甚至不表达。本发明的方法构建的单倍体诱导系中,荧光的激发波长是与手持荧光鉴别系统相配套的,可以在幼胚发育的各个时期检测荧光信号进行单倍体的鉴定,大幅提高了单倍体的鉴定效率。