本发明公开了与猪生长性状关联的逆转录病毒转座子插入多态分子标记、检测方法及应用，属于动物遗传育种领域，AEMK02000197.1:13336‑22596（SEQ ID NO:1）标记逆转录病毒+/+的个体达到30kg的日龄和100kg的日龄显著小于逆转录病毒+/‑和逆转录病毒‑/‑个体；chr9:138895584‑138904839（SEQ ID NO:2）标记逆转录病毒+/+的个体达到100kg的日龄显著大于逆转录病毒+/‑和逆转录病毒‑/‑个体；本发明的全长逆转录病毒多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，对生长性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。
本发明属于动物遗传育种领域，公开了与猪生长性状相关的两个基因3’UTR区SINE逆转座子插入多态分子标记、检测方法及应用；SPATA17‑SINERIP1和FGL1‑SINERIP1的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示；SPATA17‑SINERIP1标记纯合无插入基因型SINE‑/‑的个体背膘厚高于SINE+/+和SINE+/‑个体；FGL1‑SINERIP1标记纯合有插入基因型SINE+/+个体的三十公斤体重日龄高于SINE‑/‑和SINE+/‑个体；本发明的两个SINE转座子多态分子标记可用于猪个体的早期选择，在选配中提供分子依据，有助于提高选育效率。
