本发明属于分子生物学技术领域，涉及与猪中性洗涤纤维表观消化率相关的SNP标记、其检测方法和用途。所述SNP标记位于猪16号染色体上，所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪16号染色体上rs328747774核苷酸位点，且具有为G/C多态性，所述SNP标记与猪中性洗涤纤维消化率极显著相关。一种用于检测所述的SNP标记的引物对，上游引物为：SEQ ID NO：2，下游引物为：SEQ ID NO：3。本发明提供的SNP标记与猪的中性洗涤纤维表观消化率相关，可以通过鉴定该SNP标记来筛选高中性洗涤纤维表观消化率的猪，建立猪高中性洗涤纤维表观消化率品系具有重要的经济效益与社会价值。
本发明涉及一种与猪背膘厚性状相关的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪4号染色体rs80880668核苷酸位点的分子标记，且具有A/G多态性，所述SNP标记与苏淮猪背膘厚极显著相关(P0.001)。一种用于检测所述的SNP标记的引物对，上游引物为：SEQ ID NO：2，下游引物为：SEQ ID NO：3。本发明提供的SNP标记与苏淮猪背膘厚极显著相关，通过鉴定该SNP标记的基因型来筛选具有较薄背膘的苏淮猪品系，该品系的建立能够降低苏淮猪的背膘厚度，并且产生更多的社会和经济效益。
本发明涉及一种鉴别杜长大三元猪和长大二元猪的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记位于猪6号染色体上的MC1R基因的核苷酸序列上，所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体181697bp处含rs45435032核苷酸位点的分子标记，且具有T/C多态性，所述SNP标记在杜长大三元猪和长大二元猪群体间有差异基因型，其中杜长大三元猪为TC基因型，长大二元猪为CC基因型。一种用于检测所述的SNP标记的引物对，上游引物为：SEQ ID NO：2，下游引物为：SEQ ID NO：3。通过鉴定该SNP标记基因型来简易、高效地鉴别杜长大三元猪和长大二元猪。
