本发明公开一对高多态性石榴SSR引物PG098，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明提供的引物对PG098多态性高，利用其对22个石榴品种DNA进行扩增，仅SXXA1可特异性的扩增出215bp的条带；还可根据条带大小对AHHB24、HN06、HN11、HN13、HY04、HY05、HY25、SD20、SD27、SD57、SXXA09、SXXA16、SD16、SD59品种进行区分。
本发明公开6个怀远石榴优良品种的SSR指纹图谱，6个怀远石榴优良品种分别为：白玉石籽、大笨子、红粉皮、红玉石籽、玛瑙籽、晶花玉石籽；SSR指纹图谱是基于8对SSR引物构建的指纹图谱，8对SSR引物分别为：PG080、PG130、PG139、PG152、PG098、PG077、PG090、PG093，其核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1‑16所示，构建的6个品种的SSR指纹图谱特征如表1所示。本发明还公开了其构建方法及其应用。本发明为6个石榴品种的真伪鉴定、育种利用和新品种权利保护提供了理论依据。
本发明公开6个安徽淮北石榴优良品种的SSR指纹图谱，6个安徽淮北石榴优良品种分别为：淮北软籽2号、淮北软籽3号、冰糖籽、锦绣红、南庄超红、塔山红；SSR指纹图谱是基于10对SSR引物构建的指纹图谱，10对SSR引物分别为：PG080、PG130、PG139、PG152、PG098、PG077、PG090、PG093、PG070、PG153，其核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1‑20所示，6个品种的指纹图谱如表1所示。本发明还公开了其构建方法及其应用。本发明为6个石榴品种的真伪鉴定、育种利用和新品种权利保护提供了理论依据。
本发明公开了一对用于石榴品种鉴定的专用SSR引物PG080，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明提供的引物对PG080多态性高，利用其对22个石榴品种DNA进行扩增，仅HN12可特异性地扩增出159bp的条带，仅SXXA18可特异性地扩增出161bp的条带，仅CY01可特异性地扩增出140bp；还可根据条带大小对AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品种进行区分。
本发明公开了基于石榴全基因组序列开发的SSR核心引物组及其应用，该引物组包括11对引物：PG080、PG130、PG139、PG152、PG153、PG140、PG098、PG070、PG077、PG090、PG093，其核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1‑22所示。本发明的SSR核心引物组具有多态性高，重复性好、标记稳定、带型清晰易判读等优点，可用于石榴品种鉴定、DNA指纹图谱构建及遗传多样性评价与系统发育研究等领域，为石榴分子标记辅助选择提供了新的工具，具有良好的应用前景。
