本发明属于基因工程预防或治疗性疫苗及药物领域,具体涉及一组基于冠状病毒基因组的改进型5’UTR和3’UTR及其应用,所述的基于冠状病毒基因组的改进型5’UTR的序列如SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.4所示;基于冠状病毒基因组的改进型3’UTR的序列如SEQ ID NO.10或SEQ ID NO.12所示。与现有技术相比,本发明的优点在于:本发明中优化获得的5’UTR和3’UTR序列与天然的冠状病毒5’UTR和3’UTR序列具有十分接近或更优的目的蛋白表达效果,可用于DNA和mRNA疫苗开发或其它蛋白治疗药物发掘。本发明对于打破国外mRNA疫苗序列设计专利保护壁垒具有重大意义。