本发明公开了一种玉米矮秆基因，所述矮秆基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，并公开了如SEQ ID No.2所示的该矮秆基因编码的蛋白。还公开了该矮秆基因的CAPS分子标记，该分子标记可用于该本发明矮秆基因的早期辅助选择。本发明还公开了一种核苷酸序列如SEQ ID No.7所示的玉米矮秆相关基因。本发明玉米矮秆基因降低玉米株高效果显著，且未与不良性状连锁，拓宽了玉米的矮秆种质基础，为矮秆育种提供了一个新途径；其次，本发明发明矮秆基因由单隐性基因控制，育种方法简单，并可通过CAPS标记进行辅助选择，加快育种速度；此外，本发明提供一种玉米矮秆相关基因，可通过基因编辑手段创造更多的矮秆基因，大大扩展了矮秆基因的数量。
