本发明公开了提高尼罗罗非鱼选育效率的标记、方法、试剂盒及应用,所述标记的SNP标记引物为:上游引物SEQ ID NO:2,5’‑ACTGTCTGACCTCACAAATGTGCTT‑3’;下游引物SEQ ID NO:3,5’‑GAGGAGAAGGCGAGACTCTACGAAC‑3’。与现有技术相比,本发明具有以下优点:(1)本发明所述方法提供的SNP标记引物不受尼罗罗非鱼年龄、性别及养殖状态限制,可以用于尼罗罗非鱼早期种质鉴定,显著提升罗非鱼的保种、选育工作效率;(2)本发明所述方法选取尼罗罗非鱼Ghrelin基因启动子调控区域的SNP位点作为检测位点,对建立一种提高尼罗罗非鱼摄食行为频率和平均生长速率的辅助育种方法提供了科学依据。