本发明涉及一种重组人PE38sBAFF免疫毒素编码基因的优化和免疫毒素重组蛋白的高效表达方法,属于基因工程技术领域。本发明所述的重组人PE38sBAFF免疫毒素,氨基酸序列如SEQ ID No.1所示,编码该重组人PE38sBAFF免疫毒素的基因,核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所述的编码重组人PE38sBAFF免疫毒素的基因,非常适合在大肠杆菌中表达,同时通过发酵与纯化工艺优化,提高表达量,具有高表达、高稳定的优点。本发明可高效、简便、低成本的获得重组人PE38sBAFF免疫毒素。