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[发明专利]病原体耐药单碱基突变检测方法、装置、设备及存储介质-CN202310880903.2在审
发明人：张朋;周金升;宋佳平 -专利权人：珠海碳华检测科技有限公司;珠海碳云智能科技有限公司
申请日： 2023-07-17 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种病原体耐药单碱基突变检测方法、装置、设备及存储介质，其方法包括：对待测病原体样本进行测序，获取第一预设测序深度下的测序数据；将测序数据与待测病原体样本对应的参考基因组进行比对，确认未被测序覆盖到的待测位点；基于预先构建的强相关位点对应关系表确认待测位点对应的所有第一强相关位点；基于预设数值化方式对所有第一强相关位点的突变信息进行数值化表示，得到数值化结果；将数值化结果输入至预先训练好的单碱基突变检测模型进行预测，确认待测位点是阳性位点还是阴性位点。本发明通过位点之间的强相关性，对未被测序覆盖的待测位点，利用其对应的强相关位点的突变信息预测待测位点是否发生突变，检测准确性高。
病原体耐药碱基突变检测方法装置设备存储介质

[发明专利]病原体耐药基因检测方法、装置、设备及存储介质-CN202310880936.7在审
发明人：张朋;周金升;宋佳平 -专利权人：珠海碳华检测科技有限公司;珠海碳云智能科技有限公司
申请日： 2023-07-17 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种病原体耐药基因检测方法、装置、设备及存储介质，其中方法包括：将从待测生物样本中提取第一预设平均测序深度下的测序数据与从基因数据库中获取的同源耐药基因序列进行比对，得到多条比对记录以及每条比对记录对应的比对质量值；根据比对质量值过滤掉非最优比对，得到每个基因正确比对记录的条数；基于预设计算方式和正确比对记录的条数计算得到待检测基因的丰度得分，并根据丰度得分统计每个待检测基因的丰度得分排名；将每个待检测基因的丰度得分和丰度得分排名输入至预先训练好的耐药基因检测模型进行预测，确认待检测基因是否为真阳性耐药基因。本发明能够利用基因的丰度得分和丰度得分排名准确预测基因是否为真阳性。
病原体耐药基因检测方法装置设备存储介质

[发明专利]病原体检测方法和系统-CN202310037065.2在审
发明人：张朋;周金升;王亮;宋佳平 -专利权人：珠海碳华检测科技有限公司
申请日： 2023-01-10 - 公布日： 2023-05-05 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供了一种病原体检测方法和系统，涉及生物技术领域。本发明提供的病原体检测方法，包括：a.获取样品的宏基因组测序数据，进行序列物种注释；b.获得样品中各微生物物种的丰度排名；c.计算样品中每种微生物的序列分散度；d.判断微生物是否满足以下条件：丰度排名在前5以内；序列分散度≥0.95；属于已知病原体；e.若满足d步骤的全部条件，则判定为病原体微生物，否则，判定为不是病原体微生物。该病原体检测方法，简单方便，准确率高，结合3个指标可鉴定出引起宿主患病的病原体微生物种类。
病原体检测方法系统